波莫纳学院在1887年10月14日作为一所男女合校的高等学府建校。建校者最初的目的是模仿小型的新英格兰式的学校创立一所学院。学院最初被建立在波莫纳小镇，在1888年9月12日在一个租聘的房屋内开始了第一堂课的授课。第二年，学校迁移到了克莱蒙特镇的一个未完全建好的酒店内。这幢楼房最后变成了如今的Sumner Hall，招生办和校园事务所的办公所在地。在学校搬迁之后，学院的名字正式改成了波莫纳学院（Pomona College）。波莫纳第一批10个毕业生于1894年正式获得 学士学位证书 。
建校者们的理念始终引领着波莫纳学院秉着着 教育公平 的信仰。如同其他由 公理会 成员建立的学校一样（哈佛、达特茅斯、明德、鲍登等），波莫纳学院有着自己的 行政管理 董事会，确保其独立性。最早的一批理事会成员包括了由 威廉姆斯学院 、 达特茅斯学院 ， 科尔比学院 以及 耶鲁大学 等的优秀毕业生，一切为了为了创建一所新英格兰式的学院的目标而奋斗。在20世纪20年代初，随着学院的壮大，学校主席James A. Blaisdell，呼吁“把一群院校拆分成小型学院—类似于牛津式—使得他们能够共享图书馆以及其他设施资源”，这个决策使得波莫纳学院在保留其优良的小班文理教学的基础上能够获得宝贵的大型综合性大学的设备和资源。在1925年10月14日这个历史性的日子里， 克莱蒙特学院联盟 成立了。到1997年，这个联盟正式发展壮大到了如今的五所 顶级 文理学院和两所研究生院。
如今，波莫纳学院成为了世界上最挑剔和最富有的大学之一，波莫纳学院拥有着和常青藤盟校所媲美的SAT和ACT均分和全美最高的人均 财政预算 之一。波莫纳以高质量的本科教学，丰厚的财政补助，卓越的师资力量，优良的 生活环境 和杰出的毕业生校友在全美乃至全世界 高等教育 的舞台上立有一席之地。平均每年200多个学生的实习项目机会，200多个暑期科研项目机会，波莫纳学院是在美国有着最高的人均职业发展培养项目机会的高等院校之一。波莫纳学院在在校学生人均获得高等科研基金 百分比排名 中位列全美第8，在2013年波莫纳的在校学生取得了全美最多数量的Goldwater科研奖学金，超过全美所有文理学院甚至是有着众多学生基数的综合性大学。将近百分之85的波莫纳毕业生校友在10年之内获得研究生博士学历，其毕业校友的身影遍布全美最顶尖的硕博士项目。
波莫纳提供47个专业；希望创造自己独特的专业的学生也同样在相应的政策下受到学校的欢迎。2014年春季得到申明最多的专业，按照人数数量，分别是：经济学（97人），数学（91人），神经科学（70人），心理学（62人）， 计算机科学 （59人），化学（46人），环境分析（45人），公共 政策研究 （44人）以及英语（41人）。
大部分的波莫纳的教职工人员为在校学生们提供多种不同学科领域一对一或者 一对多 的科研项目指导。波莫纳学院为学生每年的暑期科研项目提供大量的资金支持。学生们可以选择与教授进行零距离的 课题研究 ，也可以研究自己设计的 独立项目 课题，并得到教授的指导。2012年和2013年的夏季，超过460名在校学生参与了暑期的科研项目。很多学生也同样在学年里和教授一起做课题研究或者自我研究独立课题。
波莫纳学院的平均课堂人数是15人。8：1的师生比例以及100%的教授授课率保证了本科教学的质量。85%的教授住在离学校5英里的范围内，90%的课堂人数在30人之内。波莫纳的文理 教学理念 要求学生至少在“创意表达”，“ 社会体制 与 人类行为 ”，“历史，价值与道德”，“物理与生物科学”和“数学逻辑”这五个领域内至少选修一门以上的课程。
波莫纳为学生提供几个学术中心作为学习辅助。写作辅导中心为学生提供免费的咖啡和保密的 写作能力 辅导以及论文写作咨询。写作顾问们以改进学生个体论文和提高学生综合写作能力为工作目标。量化技能中心为学生提供一对一的 个人辅导 以及定期举办工作室帮助学生提高量化能力。外语教学资源中心为学生和老师提供语言设备，个体辅导以及各类书本帮助学生进行 外语学习 。太平洋研究室为 亚洲研究 项目提供支持并在相关领域内举办工作室和会议。
