科克大学现有八个学院，分别是：人文学院、凯尔特研究学院、财经学院、法学院、自然科学院、食品科学院、工程学院以及医学院。以下为分别介绍：
人文学院
人文学院是科克大学规模最大的学院，提供下列的学士学位课程：文学学士、文学学士（欧洲研究）、文学学士（戏剧研究）、文学学士（音乐学）、文学学士（语言文化）、文学学士（应用心理学）、文学学士（幼儿教育）等学位课程。
研究学院
凯尔特研究学院开设的课程主要针对那些对爱尔兰的语言、历史及文化感兴趣的学生。学生在完成课程后可以获得荣誉学士学位，这一学位课程通常需要四年的时间。
财经学院
获得财经学院颁发的财经学学士学位通常需要四年的学习。该校开设的具体专业课程包括：财务管理、商业信息系统管理、金融管理、欧洲经济研究、公共管理等。
法学院
法学院的学生可以选择四个法律学位当中的其中一个，这四个法律学位分别是：法国法律学位、德国法律学位、爱尔兰法律学位以及普通法律学位。所有的四个学位课程都包括了基本的法学知识。法律学位课程是一个三年的课程。同时，也提供四年的学位课程，最后的一年学生将前往法国或德国实习。
自然科学院
在自然科学院就读的学生在大学一年级可以在下面四个领域范围选择其中一个领域学习：计算机科学 生物及化学研究 化学、数学及物理研究 环境保护。
食品科学院
食品科学院为学生提供了以下四年制的学士学位课程：食品科学、食品技术、营养科学、食品产业（此课程系与财经学院联合开设）、食品制造工程（此课程系与工程学院联合开设，并由工程学院颁发工程学士学位。）
工程学院
工程学院包含了四个系，分别是：制造工程系、环境工程系、电子工程系、微电子工程系。专业设置：法律，工程技术，管理，自然科学。
