Nørre Campus（北校区）：包含了大部分的健康-医药学院和部分自然科学学院，新的药学中心 ﹙Pharma Science Centre﹚、马士基大楼 ﹙The Mærsk Builing﹚、尼尔斯·玻尔大楼 ﹙The Niels Bohr Builing﹚ 已竣工或正在兴建中，未来会将该校区规划成哥本哈根科学城 ﹙Copenhagen Science City﹚
Freeriksberg Campus（腓特烈堡校区）：自然科学学院的主校区，同时包含部分健康-医药学院，2016年初启用新的哥本哈根植物学中心 ﹙Copenhagen Plant Science Centre﹚ ；
City Campus（城市校区）：现社会科学学院、法学院、神学院、行政部门所在地，也包含了部分自然科学学院及健康-医药学院，在获得丹麦环境部VILLUM基金会、诺和诺德基金会等多个基金会的资助后，新的自然历史博物馆亦在计划中；
Sønre Campus（南校区）：主要是人文学院和小部分自然科学学院，预计2016/17学年冬季扩建 ﹙KUA3﹚ 完成，届时法学院和神学院亦将迁址至此；
现今的六大学院为健康与医药科学学院、人文学院、法学院、理学院、社科学院和神学院：
法学院：合并为一个科系，有10个研究中心；
社科学院：5个系和6个研究中心；
人文学院：就读人数超过学校学生总数的一半，拥有8个系，13个研究中心；
神学院：合并为一个科系，有6个研究中心，同时另设有1个非洲研究中心；
理学院：10个系，30个研究中心（包括尼尔斯·玻尔研究所），以及附属的丹麦自然历史博物馆 ﹙Natural History Museum of Denmark﹚ ；
医药与健康科学院：16个系，22个研发中心，以及附属的23家医院和1个糖尿病医疗研究中心的联合体 —— 哥本哈根大学医院 ﹙Copenhagen University Hospital﹚，1家宠物医院 ﹙University Hospital for Companion Animals﹚，1家大型动物教学医院 ﹙Large Animal Teaching Hospital﹚；
大学排名
世界第26位，北欧第1位，欧陆第2位，2019软科世界大学学术排名
世界第46位，2019莫斯科国际大学排名
世界第39位，北欧第1位，欧陆第4位，2020CWUR世界大学排名
世界第18位，北欧第1位，欧陆第2位，2020URAP世界大学学术排名
世界第32位，北欧第1位，欧陆第2位，2020U.S. News世界大学排名
世界第33位，2020软科世界大学学术排名
世界第52位，2020莫斯科国际大学排名
世界第84位，2021泰晤士高等教育世界大学排名
世界第76位，2021QS世界大学排名
世界第34位，2021U.S. News世界大学排名
优势专业
数学 ﹙Master of Science in Mathematics﹚、物理学及天文 [Master of Science in Physics ﹙Astrophysics, Geophysics, Biophysics an Quantum Physics﹚]、化学 ﹙Master of Science in Chemistry﹚：学校的传统强系；而哥本哈根大学与瑞典隆德大学联合主持的同步辐射装置MAX IV，以及欧洲散裂中子源项目 ﹙European Spallation Source ﹚，势必促进多种学科的强势增长；
地质和地球科学 ﹙Master of Science in Geology-Geoscience﹚：隶属于实力雄厚的IGN ，如 Hans Thybo 教授为欧洲地球科学联盟 ﹙European Geosciences Union﹚ 主席；其所在的 Geocenter Denmark 是欧洲最重要的地学研究与教学中心之一，同时亦为 GEUS（Geological Survey of Denmark an Greenlan，丹麦-格陵兰地质调查局）所在地。自然历史博物馆的地球遗传学中心 ﹙Centre for GeoGenetics, Natural History Museum of Denmark﹚ 也与之有着紧密联系——这是一个跨学科中心，主要由遗传学家和地质学家组成，研究内容丰富：从研究欧洲冰河世纪猛犸象的迁移，到追踪最早的人类在澳大利亚的足迹；从分析格陵兰岛重达20吨的陨石，到理解早前的气候变化并预测其对未来的影响；从检测各类疾病的遗传背景，到探索一雌多雄对绿海龟生存情况的影响；
经济学﹙Master of Science in Economics﹚、数理经济学 ﹙Master of Science in Mathematics-Economics﹚：其计量经济学举世瞩目，与数学系组成强大的数理经济学金融计量基地。同时，哥本哈根大学拥有一个不完善知识经济学研究中心，隶属于索罗斯创建的Institute for New Economic Thinking ﹙INET﹚。在2014年国际计量经济学博弈赛 ﹙Worl Championship of Econometrics﹚ 中，哥本哈根大学的团队击败来自哈佛大学、剑桥大学、牛津大学、奥胡斯大学和法国国立统计与经济管理学校等高校的对手，获得冠军 ；
农学 ﹙Master of Science in Agriculture﹚、食品科学 ﹙Master of Science in Foo Science an Technology﹚：农学专业与荷兰瓦格宁根大学 （荷兰瓦赫宁根大学）同为世界顶尖，Plant & Animal Science、Agricultural Sciences 分列全球第7位、第9位 ﹙NTU Ranking﹚；Agricultural an Veterinary Sciences、Environmental Sciences 分列全球第7位、第10位 ﹙URAP﹚；Plant an Animal Science、Agricultural Sciences 分列全球第12位、第14位 ﹙U.S.News﹚；食品专业亦获得了Arla和嘉士伯等国际巨头的支持；
生物信息 ﹙Master of Science in Bioinformatics﹚：依托强大的BRIC ﹙Biotech Research an InnovationCentre﹚ 和生物信息研究中心 ﹙Bioinformatics Centre﹚ ，其Biological Sciences 全球第12位 ﹙URAP﹚；Biology an Biochemistry、Molecular Biology an Genetics 分列全球第22位、第32位 ﹙U.S.News﹚；
药学 ﹙MSc in Pharmaceutical Sciences﹚、国际健康 ﹙Master of Science in Global Health﹚：其医药健康类与 Karolinska Institutet ﹙卡罗林斯卡学院﹚ 同属国际一流，其中Pharmacology an Toxicology 全球第7位 ﹙U.S.News﹚；Pharmacology & Toxicology 全球第11位 ﹙NTU Ranking﹚；Meical an Health Sciences 全球第20位 ﹙URAP﹚；学校的地理位置、资源和人脉在欧洲三大最佳生物科技创新基地之一的医谷 ﹙Meicon Valley﹚ [39] 更有着得天独厚的优势；哥本哈根同时也是世界卫生组织的欧洲总部所在地。哥本哈根大学与世界卫生组织 ﹙WHO﹚、世界医学教育联合会 ﹙WFME﹚、国际医学教育与研究促进基金会 ﹙FAIMER﹚ 拥有合作关系，负责掌管和维护由国际医学教育名录 ﹙IMED﹚ 和阿维森纳名录 ﹙Avicenna Directory﹚ 合并而成的世界医学院校名录 ﹙Worl Directory of Meical Schools ﹚；
气候变化 [Climate Change, Impacts, Mitigation an Aaptation ﹙CCIMA﹚]：跨院系授课，兼顾自然科学（如Geophysics是Niels Bohr Institute的重要研究领域之一）和社会科学（如Political Science是全国入学要求最高的专业之一）；各授课地点距离北校区 骑车不超过10分钟；
Maersk Tower 内部教室
跨学科研究 ﹙Transisciplinary research﹚：哥本哈根大学的特长领域，Multiisciplinary 全球第28位 ﹙URAP﹚；如 Niels Bohr Institute 的Biophysics是跨越物理学和生命科学的综合性领域；合成生物学 ﹙Synthetic Biology﹚ 是化学、纳米科学、生物物理学等的交叉学科；Dynamical Systems Interisciplinary Network [41] 则通过多学科紧密合作， 借助数学及计算机建模和统计学、生理和神经科学、心理学、计量经济学、生物信息学、生物统计学等，合力攻克复杂系统问题。
