首先，从字面上来说，ME（也可以为M. Eng）与MS都是指工科专业的硕士Master学位，ME为Master ofEngineering，MS 为Master of Science，可以明确的一点，这两种硕士没有什么正规和不正规之分，只是设立的目的不同，叫的名字不一样而已。
再次，从美国院校来讲，工程专业硕士学位设置一般分为四种情况：第一类是只开设MS，这种属于大类，绝大多数学校只有这一个硕士学位；第二类，同时开设ME和MS学位，而这俩学位的课程设置与研究方向几乎无区别；第三类，同时开设ME和MS学位，而这俩学位的课程设置与研究方向有很大区别；第四类，只开设ME学位。
然后，我结合具体学校情况，从四个方面给大家分析一下ME与MS的常见区别：
- 课程设置 一般同时设有MS与ME学位的学校，总学分要求一般差不多，为30-36个学分毕业。ME为职业导向型，比较professional，偏重课程实践、工作运用类，要么是全部授课制完成学位，要么是会有grauation esign project要求；
而MS为学术导向型，注重research，偏重学术研究类，毕业前通常都会有grauation thesis或report要求。同时，ME所开设的课程更加灵活、实用性强，除了学习本系开设的课程外，学生也可以学习像商科，政策，计算机科学以及其它工科的交叉项目。
例如： 加州伯克利大学机械工程专业的M. Eng与MS学位，MS有两种Plan可以选择，Plan1是要求完成20units 和 a thesis, Plan II 要求24 units 和an oral presentation an report；而M. Eng则要求完成25Semester Units，是设置在ColemanFung Institute for Engineering Leaership下的学位项目； 弗吉尼亚大学机械工程专业的ME与MS学位，MS要求学生参加inepenent research，最后有a final thesis/efense；而ME为ourse-base egree with no research requirement，含有两门管理可持续开发与全球经济制造的Commerce 课程； 伊利诺伊大学香槟山机械工程专业的M. Eng与MS学位，MS要求学生完成24学分的课程与8 hours 的 Thesis Research，而M.Eng明确表示为coursework-onlyegree ，要求at least4 hours of professional evelopment coursework；
2. 学制长度 ME与MS两个学位在学制长度设置上也存在着一定的差异。首先，大多数美国学校开设ME学位的时间在9个月至18个月不等，也就是通常会由2个学期或者是3个学期完成这一学位，同时不需要完成论文只是完成相应的学习或实践项目就可以毕业获得学位。所以，ME学位的设置一般是用来满足那些想短时间内获得学位并参加工作的申请人。而对于想从事学术研究的申请人，美国大学则设置了MS这一学位，一般要求学生需要学习4个学期到6个学期，也就是1.5年至2年，同时要求学生在毕业前完成相应的毕业论文。
例如：上面提到的加州伯克利大学的MS一般学制为1.5年或3个学期，而M. Eng则为9个月或2个学期；弗吉尼亚大学机械工程专业的ME可一年完成，而MS一般1.5年左右；伊利诺伊大学香槟山机械工程专业的MS为1.5年到2年，而M. Eng若全日制学习，可在一年内完成。
