生物统计( biostatistics) 即用数理统计的原理和方法,分析和解释生物界的种种现象和数据资料,以求把握其本质和规律性。这个专业非常 interisciplinary ,跟统计、生物信息、计算机(尤其是 ata mining)等关系很密切。
生统学什么?在美国的专业设置以及课程设置是怎样的?
先从生物统计项目的开设情况说起,在美国 top30的学校中,有19所学校开设了生统的master项目,top70的院校中超过一半的学校均开设有biostatistics项目。
按学院名称分类:
school of public health
school/ college of meicine, meical center
-e.g. uke, u penn, wustl, usc, case etc.
school of arts an science
-e.g. uc, connecticut etc.
这其中,大部分学校是开设在公共卫生学院下的( school of public health)
按项目名称分类:
-ms/ma in biostatistics
-mph/msph in biostatistics
mph in biostatistics 核心课程 , 以 emory为例 :
statistical methos-统计方法
statistics for experimental biology-统计实验生物学
biostatistical methos-生物统计方法
statistical inference-统计推断
probability theory-概率论
moern regression analysis-现代回归分析
sas programming-sas编程
statistical computing-统计计算
stochastic processes-随机过程
一般来说要求的先修课程:
multivariable calculus-多元微积分
linear algebra-线性代数
probability-概率论基础
theoretical an applie statistics-理论和应用统计学
one statistical system r(sas)-一门统计学软件比如sas或者r
one computer language c(python,java)-一门计算机语言,c/c++
ms in biostatistics课程设置,以wustl为例:
biostatistics pathway:
statistical computing with sas-应用sas的统计计算
funamentals of genetic epiemiology-遗传流行病学原理
r primer
introuction to bioinformatics-生物信息学导论
biostatistics i,ii-生物统计学
introuction to epiemiology-流行病学导论
stuy esign an clinical trials-研究设计和临床试验
survival analysis-生存分析
ethical & legal issues in clinical research
internship preparation
biostatistics consulting lab
thesis or electives*
从 research area来看,主要领域为:
1.临床统计学 clinical statistics
-生存分析(survival analysis),主要处理临床实验中的个体寿命,是研究生存现象和响应时间数据及其统计规律的一门学科。该方向近二三十年来一直受到国内外统计学家的关注。生存分析以前主要用kaplan-meier和cox两大模型,现在又出现了frailty moels, accelerate failure time moels, transformation moels等新的理论。
-纵向数据分析(longituinal ata analysis),主要处理临床实验中对同一个体重复观测得到的数据。描述纵向数据常用的模型有ranom effects moels,marginal moels等等。
-临床试验设计(clinical trial an esign),主要研究在随机化实验中,如何在保证统计功效的条件下,尽可能让患者接受新药治疗(intention to treat)进行实验设计。这方面较新的理论是alpha spening functions。
-运用统计手段研究遗传学与分子生物学中的问题,统计手段有:建模,monte carlo等等。教授通常是通过基因表达数据对基因的调控行为与功能进行研究。