地质学系
地质学系培养土地科学理论与应用基础研究领域的专家。该系学生不仅能获得现代地质学诸多领域深厚的理论知识，还可成为该科学应用方面具有高度专业知识的专家。就读期间向学生提供各种科学实验。本系设有几个供学生进行暑期地质实习的设备良好的基地。其中最大的克里米亚。在黑海和波罗的海进行海洋地质考察。
地理学系
莫大地理学系拥有当今世界最大的地理学家教育科研集体，每年有近300名学生毕业。该系毕业生受到生态环境保护，地区经济，地球信息学，全球气候模拟等领域专家的高度评价。
土壤学系
莫斯科大学土壤学系成立于1906年，不仅是俄罗斯，也是全世界基础土壤学领域最大的学术研究机构。该系现有近300名教职员工，其中教授20名，国家博士32名，普通博士（ph.）125名。
基础医学系
本系教学的特点是培养能够独立进行科研的世界一流水平的医生，重点进行符合当代医学标准的科学领域研究工作。
该系主要目标是利用当代最新的信息和教学工艺（包括meline, neuroscience inex等）：培养符合俄罗斯高等教育标准培养临床专业的医务工作者；通过莫斯科大学各专业知名专家和科研机构的力量对基础和临床医学进行深入研究；在医学实践中研究和获得医疗诊断和治病最新方法。
历史系
莫斯科大学历史系是俄罗斯历史领域主要教学与科研中心之一。全系共有300多名教授，教师及其他工作人员。莫斯科大学其他系的教师及俄罗斯科学院的知名学者也在本系授课。莫斯科大学历史系在历史科学方法理事会框架内，把俄罗斯高校中40多个历史系联合起来。
法律系
莫斯科大学法律学系是培养法学专业高级律师人才的摇篮。该系成立于1755年莫大建校之时，是莫大最早的系。
语言系
莫斯科大学语文系在培养语文学家方面居各大学之先，它把语言科学方法理事会框架内六十多个本国语言系与罗曼－日耳曼语言系联合起来。该系设有语文方面各科最新大学课程，并有供国内外使用的教科书与教材。
外语系
在社会文化领域中，该系在一下三个方面研究西欧及东欧语言：应用语言学（语言教学法和翻译理论，单语与双语词典学，术语与术语学）；语言交际理论（普通演讲术、局部演讲术，媒体语言，文语交际文献学，商业交际）；文化学（文化人类学，应用文化学，文学与文化对比研究，跨文化交际）
哲学系
哲学系讲授哲学、政治学、宗教学基础知识。
经济系
莫斯科大学经济系建立于1941年，今天该系共有178名教师和192名工作人员，1800名学生，500多名博士研究生。
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