力学数学系
莫斯科大学力学数学系是世界最大数学中心之一。本系培养力学、数学、应用数学领域知识面宽广的专家，他们不仅掌握理论知识，也具备科学实验技能。近2500名大学生、研究生就读于该系。力学数学系拥有近350名教授、副教授、助教和工作人员。
计算数学与控制理论系
计算数学与控制论系是人类知识急剧发展的应用数学和信息学领域主要数学与科研中心。本系培养与教育、科学、工业、经济和管理的计算技术应用相关众多问题专家。现该系有250多位教授和教师，其中80位国家博士，8位俄罗斯科学院院士和10位通讯院士。
物理学系
建系于1933年，现在物理系有35个教研室，组成6个专业大组，本科生2300人，研究生400人，教师队伍总数为827人（包括79位兼职），其中国家博士258人，普通博士485人。每三个在物理学、地球物理学和天文研究领域方面的俄罗斯科学院院士和通讯院士中就有一名毕业于莫斯科大学物理系。
化学系
莫斯科大学是世界著名的化学研究领域的专家培养中心。本系专家全面从事现代化学领域的科研工作，由12名科学院士、3名俄罗斯科学院通讯院士和180名博士教授组成的强大教学班子来教授当代大学生使之成为现代化学家。他们研制出新型半导体及高温超导材料，合成了上百种新的复杂有机化合物与基本有机化合物，研制了新型药物和具有液晶性质的聚合物。他们还开创了光化学、电化学、高弥散系统化学等新的方向。
材料科学高等学院
为培养材料科学领域掌握高深理论知识和必要实践经验的优秀专家，根据俄罗斯科学院院士尤·德·特列季亚科夫德倡议，1991年在莫大组建材料科学高等学院。
生物学系
生物学系于1930年在莫大物理数学系生物组的基础上建立。本系有24个教研室，7个专题实验室，50多个教学科研实验室，两个生物站，其中一个位于距莫斯科不远的兹维尼格勒，另一个称为白海生物站，座落于白海岸边。学生们在动物博物馆和植物园进行实习。在俄罗斯科学院"普奥生物研究中心"有生物系分系。该系工作着12名俄罗斯科学院院士、6名通讯院士、50多名教授，大部分的老师都具有博士学位
生物工程与生物信息系
由于生物科学飞速发展与广泛的应用，所以产生了生物工程与生物信息的专业学科，这个学科主要研究新的技术工艺和新的材料特别针对医学和工业。
地质学系
地质学系培养土地科学理论与应用基础研究领域的专家。该系学生不仅能获得现代地质学诸多领域深厚的理论知识，还可成为该科学应用方面具有高度专业知识的专家。就读期间向学生提供各种科学实验。本系设有几个供学生进行暑期地质实习的设备良好的基地。其中最大的克里米亚。在黑海和波罗的海进行海洋地质考察。
地理学系
莫大地理学系拥有当今世界最大的地理学家教育科研集体，每年有近300名学生毕业。该系毕业生受到生态环境保护，地区经济，地球信息学，全球气候模拟等领域专家的高度评价。
土壤学系
莫斯科大学土壤学系成立于1906年，不仅是俄罗斯，也是全世界基础土壤学领域最大的学术研究机构。该系现有近300名教职员工，其中教授20名，国家博士32名，普通博士（ph.）125名。
基础医学系
本系教学的特点是培养能够独立进行科研的世界一流水平的医生，重点进行符合当代医学标准的科学领域研究工作。
该系主要目标是利用当代最新的信息和教学工艺（包括meline, neuroscience inex等）：培养符合俄罗斯高等教育标准培养临床专业的医务工作者；通过莫斯科大学各专业知名专家和科研机构的力量对基础和临床医学进行深入研究；在医学实践中研究和获得医疗诊断和治病最新方法。
历史系
莫斯科大学历史系是俄罗斯历史领域主要教学与科研中心之一。全系共有300多名教授，教师及其他工作人员。莫斯科大学其他系的教师及俄罗斯科学院的知名学者也在本系授课。莫斯科大学历史系在历史科学方法理事会框架内，把俄罗斯高校中40多个历史系联合起来。
法律系
莫斯科大学法律学系是培养法学专业高级律师人才的摇篮。该系成立于1755年莫大建校之时，是莫大最早的系。
语言系
莫斯科大学语文系在培养语文学家方面居各大学之先，它把语言科学方法理事会框架内六十多个本国语言系与罗曼－日耳曼语言系联合起来。该系设有语文方面各科最新大学课程，并有供国内外使用的教科书与教材。
外语系
在社会文化领域中，该系在一下三个方面研究西欧及东欧语言：应用语言学（语言教学法和翻译理论，单语与双语词典学，术语与术语学）；语言交际理论（普通演讲术、局部演讲术，媒体语言，文语交际文献学，商业交际）；文化学（文化人类学，应用文化学，文学与文化对比研究，跨文化交际）
哲学系
哲学系讲授哲学、政治学、宗教学基础知识。
经济系
莫斯科大学经济系建立于1941年，今天该系共有178名教师和192名工作人员，1800名学生，500多名博士研究生。
新闻系
系主任：雅.尼.扎苏尔斯基 教授
目前在俄罗斯及国外各传媒工作的15000新闻工作者为该系毕业生。自新闻系成立之日起，已有500多名外国留学生从该系毕业。本系有教授21人，副教授65人，教员及其他工作人员121人，目前在系学习的俄罗斯学生近2200人，外国留学生约100人，进修生12人，博士研究生26人。
新闻系学生入系时必须提供学历证书和成绩单原件，成绩单上需要有毕业论文题目及评分。
心理学系
本系有110名教师，包括1名俄罗斯科学院通讯院士，10名院士及教育院士，36名教授/国家博士，58名副教授/博士（ph.），104名其他工作人员（包括4名国家博士和60名ph.）。
社会学系
莫斯科大学社会系成立于1989年，本系共有12个教研室，3个实验室，700多名本科生、硕士生，200多名ph. 和进修生，其中包括来自以下13个国家和地区的留学生：中国、韩国、日本、中国台湾、美国、墨西哥、阿塞拜疆等。
艺术系
莫斯科大学已于2001年7月正式开设艺术系。2002年正式对中国招生。主要培养各类艺术和一般艺术理论方面的学士和硕士，注重理论与实践的结合。毕业生应该具有完整的世界观，理解艺术规律性及艺术表现形式，掌握艺术创造基本技能，能够进行艺术评论分析和艺术坚定与咨询活动。毕业生主要从事艺术教育、文化传播和艺术创作活动。
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