日本的学费与其他国家相比是比较低廉的。一般语言学校一年的费用为 60 万～ 75 万日元之间。大学和大学院中的国公立院校一年的费用在 70 万～ 80 万日元之间 ﹙ 医药学除外 ﹚ 。私立大学稍贵一些，一年费用要 80 万～ 120 万日元 ﹙ 医药学除外 ﹚ 。短期大学与专门学校学费是一年 80 万 ~120 日元左右。
住宿费则有很大的地域性差别，东京等大城市费用较高，住宿一个月需要 2 万 ~4 万日元。偏僻一点的城市会便宜很多，可能只是东京的 1⁄2 或 1⁄3 。
日本的生活费用较高，以东京地区为例，其物价水平可以达到国内一些城市的 5 倍左右。正常在日本生活的中国学生一个月费用最少要 2 万～ 3 万日元 ﹙ 折合人民币在 1500-2500 之间 ﹚ 。
日本是留学国家中给自费留学生大量奖学金的国家。日本的文科学省、地方公共团体、民间团体等都为留学生提供奖学金，留学生可以在校提出申请。
此外，日本国际教育协会对于在日本各种私立大学内学习正规课程的外国人、自费留学生，都设有不同程度的学费援助制度，根据成绩最多可达到学费部分减免。
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