力学数学系
莫斯科大学力学数学系是世界最大数学中心之一， 主要培养力学、数学、应用数学领域知识面宽广的专家，他们不仅掌握理论知识，也具备科学实验技能。
计算数学与控制理论系
此系主要培养与教育、科学、工业、经济和管理的计算技术应用相关众多问题专家。
物理学系
建系于 1933 年，每三个在物理学、地球物理学和天文研究领域方面的俄罗斯科学院院士和通讯院士中就有一名毕业于莫斯科大学物理系。
化学系
莫斯科大学是世界著名的化学研究领域的专家培养中心。此系专家全面从事现代化学领域的科研工作，开创了光化学、电化学、高弥散系统化学等新的方向。
生物学系
生物学系于 1930 年在莫大物理数学系生物组的基础上建立。本系大部分的老师都具有博士学位。
生物工程与生物信息系
这个学科主要研究新的技术工艺和新的材料特别针对医学和工业。
地质学系
该系学生不仅能获得现代地质学诸多领域深厚的理论知识，还可成为该科学应用方面具有高度专业知识的专家。
地理学系
莫大地理学系拥有当今世界最大的地理学家教育科研集体，该系毕业生受到生态环境保护，地区经济，地球信息学，全球气候模拟等领域专家的高度评价。
土壤学系
莫斯科大学土壤学系成立于 1906 年，不仅是俄罗斯，也是全世界基础土壤学领域最大的学术研究机构。
基础医学系
本系教学的特点是培养能够独立进行科研的世界一流水平的医生，重点进行符合当代医学标准的科学领域研究工作。
历史系
莫斯科大学历史系是俄罗斯历史领域主要教学与科研中心之一。
法律系
莫斯科大学法律学系是培养法学专业高级律师人才的摇篮。该系成立于 1755 年莫大建校之时，是莫大最早的系。
语言系
莫斯科大学语文系在培养语文学家方面居各大学之先，它把语言科学方法理事会框架内六十多个本国语言系与罗曼－日耳曼语言系联合起来。
外语系
在社会文化领域中，该系有应用语言学、语言交际理论、文化学等专业。
哲学系
哲学系主要讲授哲学、政治学、宗教学基础知识。
新闻系
目前在俄罗斯及国外各传媒工作的 15000 新闻工作者为该系毕业生。
社会学系
莫斯科大学社会系成立于 1989 年，该系有来自 13 多个国家和地区的留学生。
艺术系
莫斯科大学主要培养各类艺术和一般艺术理论方面的学士和硕士，注重理论与实践的结合。
国家管理系
该学院培养 “ 国家与市政管理 ” 专业高级人才，培训联邦、地区及市属各政府机关的工作人员。
