据日本 文部科学省 发布，日本目前拥有国立大学 86所，公立大学86所，私立大学603所，计775所大学。学生数量方面，国公立大学由于学校数量较少，加上招生严格和学费低廉，所以学生数仅占全体的百分之五。
由于世界大学排名主要依据学术研究，所以担负着研究机构的国立大学有较好的世界排名和知名度，交大日本大学学术排名前十均为国公立大学。而私立大学由于已毕业学生规模在社会较多，因此在日本就职时略占优势。
日本官方没有私立大学排名，依据国立大学排名及日本民间对大学的一个印象大致分级，结合学术排名和就业水平，反应日本人眼中大学档次。另外各院校拥有不同的优势学科，诸如东京大学法学部、 一桥大学 经济学部、 东北大学 文学部、 大阪大学 外国语学部。
民间排名把日本的大学共分为了 S级到F级。其中，S级大学最好，是国际超一流大学；A级其次，是国际一流大学；再往下是B类国内一流大学、C类国内准一流大学、D类国内二流大学，以此类推超过600所大学被归为E、F级别大学。
日本有四所大学院大学，由于没有本科设置，不参与排名 :
综合研究大学院大学 、 政策研究大学院大学 、 北陆先端科学技术大学院大学 、 奈良先端科学技术大学院大学 。
参考国际排名以及日本国内高考难度和就业指标对各大学的印象大致分级，可分为 S级到F级。
S级大学
【 S1】： 东京大学
【 S2】：京都大学、东京工业大学、 一桥大学
A级大学
【 A1】： 大阪大学
【 A2】： 名古屋大学 、 东北大学
【 A3】： 九州大学 、 北海道大学 、 庆应义塾大学 、 早稻田大学
B级大学
【 B1】： 筑波大学 、 神户大学 、 东京外国语大学 、 东京医科齿科大学
【 B2】： 横滨国立大学 千叶大学 广岛大学 御茶水女子大学
【 B3】： 首都大学东京 大阪市立大学 明治大学 上智大学
C级大学
【 C1】： 金泽大学 冈山大学 熊本大学 电气通信大学 东京艺术大学 大阪教育大学 京都工艺纤维大学 名古屋工业大学 东京理科大学同志社大学 青山学院大学 关西学院大学 立教大学 东京学艺大学 三重大学 鹿儿岛大学
【 C2】： 埼玉大学 新泻大学 静冈大学 中央大学 东京农工大学 九州工业大学 横滨市立大学 大阪府立大学 北九州市立大学 京都教育大学 名古屋市立大学 学习院大学 立命馆大学 东京海洋大学 国际教养大学 神户市外国语大学 兵库县立大学 福冈女子大学 爱知县立大学
【 C3】： 法政大学 关西大学 明治学院大学 专修大学 滋贺大学 信州大学 群马大学 茨城大学 京都府立大学 南山大学 成蹊大学
D级大学
地方公立文系大学等
东洋大学 驹泽大学 国士馆大学 东海大学 龙谷大学 甲南大学 武藏大学 东京都市大学 等
首都圈京阪神地区中日本地区各大中坚私立大学、专业性理工科大学等近 50所大学
E级大学
首都圈普通私立大学等近 100所大学
F级大学
近 500所各式各样私立大学
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