马来西亚高等教育体系包括公立和私立两部分。公立高校包括公立大学、公立学院和技术职业学院，私立高校包括私立大学、私立大学学院、私立学院和外国大学分校。公立大学、私立大学、私立大学学院和部分公立学院具有颁发本校大专及大专以上文凭的资格。专科学制2-3年，本科学制3年，硕士学制1-2年、博士学制2-6年。
马来西亚教育部是高等教育主管部门，对高校的设立行使行政审批权。马高校所开设课程需经教育部以及国家学术鉴定局（MQA）双重核准。国家学术鉴定局还负责对课程质量的监督审查，各校经认证的课程可在其网站上查询（网址：http://www.mqa.gov.my/mqr/inex.htm）。
马来西亚现有公立大学20所、私立大学43所、大学学院10所、私立院校3所。各高校招收国际学生的资质需经马教育部和内政部双重核准，目前具备该资质的高校除20所公立大学外，还有239所私立高校。马高校大多以英文授课，部分私立大学学院和私立学院设立了与国际接轨的双联课程，引进英、美、加、澳、新西兰等国高等教育课程，学生毕业可获颁这些国家高校的大学本科及以上文凭，该文凭受到世界多数国家认可。
公立大学
学校名称：Universiti Malaya (UM)
中文译名：马来亚大学
备注：研究型公立大学
学校名称：Universiti Putra Malaysia (UPM)
中文译名：马来西亚博特拉大学
备注：研究型公立大学
学校名称：Universiti Kebangsaan Malaysia (UKM)
中文译名：马来西亚国民大学
备注：研究型公立大学
学校名称：Universiti Sains Malaysia (USM)
中文译名：马来西亚理科大学
备注：研究型公立大学
学校名称：Universiti Teknologi Malaysia (UTM)
中文译名：马来西亚理工大学
备注：研究型公立大学
学校名称：Universiti Peniikan Sultan Iris，UPSI
中文译名：苏丹依德理斯教育大学（师范大学）
备注：专业型公立大学
学校名称：Universiti Utara Malaysia (UUM)
中文译名：马来西亚北方大学
备注：专业型公立大学
学校名称：Universiti Malaysia Sabah (UMS)
中文译名：马来西亚沙巴大学
备注：复合型公立大学
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