1825年，来自马里兰州的耶稣会士本尼迪克特·约瑟夫·芬威克（SJ）成为波士顿的第二任主教。他是第一个提出“波士顿市大学”愿景的人，该愿景将培养新一代的领导人，以满足他刚刚成立的教区的公民和精神需求。
1827年，芬威克主教在其大教堂的地下室开设了一所学校，并接受了这座城市青年的个人指示。波士顿距离马里兰州耶稣会活动中心的距离以及该市新教精英们的怀疑，阻碍了他吸引其他耶稣会士加入教职的努力。。波士顿的公民领袖的关系恶化，使得当耶稣会的教师终于固定在1843，芬威克决定离开波士顿学校，而是打开了圣十字学院 45英里（72公里）城西在马萨诸塞州伍斯特哪里他认为耶稣会士可以更大的自主权运作。
同时，约翰·麦克艾罗伊（John McElroy，SJ）坚持在波士顿开设一所大学的愿景，鉴于波士顿天主教爱尔兰移民人口的不断增长，他对这样一个学院的需求更大。在耶稣会上级的批准下，麦克尔罗伊开始筹集资金，并于1857年为马萨诸塞州波士顿南区哈德逊附近哈里森大街的“波士顿学院”购买了土地。。1859年，学院的两座建筑-一所学校和一所教堂 -几乎没有大张旗鼓地欢迎他们的第一堂课。两年后，卑鄙的卑鄙下，卑诗省再次关闭。内战的爆发以及协会内部对学院的管理和财务状况的分歧困扰着它短暂的第二个化身。卑诗省无法从马萨诸塞州反天主教立法机关获得宪章，这只会使麻烦更加复杂。
