佛罗里达大学是美国最大的研究型大学之一。根据该大学食品与农业科学研究所 2019年的研究，该大学为佛罗里达州的经济贡献了169亿美元，并在2017-18财年提供了13万个工作岗位。米尔肯研究所将佛罗里达评为生物技术研究向市场转移的美国前五名机构之一（2006年）。大约有50家生物技术公司来自教师研究计划。佛罗里达州一直位居许可行业前十名大学之列。特许权使用费和收入包括青光眼药物Trusopt，运动饮料Gatorae和Sentricon 白蚁消除系统。食品和农业科学研究所在NSF研究与开发中排名第一。在2005年授予的专利数量中，佛罗里达州在所有私立和公立大学中排名第七。
佛罗里达大学在2018年的赞助研究中获得了8.376亿美元的年度研究经费。研究包括医疗保健和柑橘生产（世界上最大的柑橘研究中心）等多个领域。2002年，佛罗里达州获得了美国航空航天局（NASA） 1500万美元的资助，开始领导其他六所大学，在五年期间从事与太空相关的研究。该大学与西班牙的合作伙伴关系帮助在加那利群岛创建了世界上最大的单孔径光学望远镜（成本为9300万美元）。佛罗里达大学也在计划建造一个50,000平方英尺（4,600 m 2）与伯纳姆医学研究所合作的研究机构，该研究所将位于佛罗里达州奥兰多市的中佛罗里达大学健康科学校园中心。研究将包括糖尿病，衰老，遗传学和癌症。
在过去的十年中，佛罗里达大学在太空科学领域取得了长足的进步。天文部门对图像检测设备的开发引起了资金，望远镜时间和学术成就的增长。有机化学教职员工在天体生物学方面取得了显着发现，而物理教职员工则积极参与了激光干涉仪引力波天文台项目，这是NSF资助的最大，最雄心勃勃的项目。通过机械和航空航天工程系，佛罗里达大学是NASA大学研究，工程和技术学院（URETI）未来航天运输项目的牵头机构，以开发下一代航天飞机。
