1985年，佛罗里达大学受邀加入美国大学协会（AAU），该协会是在美国和加拿大拥有62所学术上著名的公立和私立研究型大学的组织。佛罗里达州是AAU所属的17所公立大学之一。2009年，总统伯尼·马兴（Bernie Machen）和佛罗里达大学董事会宣布了该大学的一项重大政策转变。
董事会支持减少本科生人数以及将财务和其他学术资源转移到研究生教育和研究方面。2017年，根据《美国新闻》，佛罗里达大学成为佛罗里达州第一所入选十所最佳公立大学的大学。佛罗里达大学在2018财政年度的赞助研究中被授予年度研究支出8.376亿美元。
2017年，大学校长肯特·富克斯宣布了一项计划，聘请500名新教师，以跻身前五名最好的公立大学；大多数新的教职员工将被雇用于STEM领域。截止到2019年秋季，已经雇用了230名教师，其余270名教师。
