一、日本留学签证办理流程：
1、确认递签资料：每个领馆的官网上都列有必要的材料清单，以及该领馆代办机构。按照官网上的要求准备资料，并去联系代办机构询问是否有补充材料。
2、准备递签资料：材料根据大家所处城市要在哪个领馆递签内容等都会有一些变动。可以参照地区归属的领事馆，然后在根据领事馆指定的代办中心去提交资料既可。
3、缴纳签证费用：每个代办处的费用有所不同，具体请咨询当地代办机构。
4、递交签证材料：当把材料和费用都交给代办机构以后，代办机构会去大使馆递签，具体的递签时间要和代办处进行确认。
5、等待出签：在办理日本留学签证的时候，对于材料的审查也是相当严格的，其间还可能会接到大使馆的电话调查。材料递交大使馆以后要保证手机畅通，应对电话调查，进而等待出签。
二、日本留学签证拒签原因：
1、从申请人的入国经历、在留情况判断，不认为申请内容具有可信度
A、有遣返经历
B、有强制驱逐经历
C、过去有不良的在留情况
D、没有申报过去的入国经历
2、从申请人的经历来看，不认为申请内容具有可信度
A、对于过去所指出的拒签理由书既无说明，也没有证明
B、对于过去所指出的拒签理由书既没有说明，证明也不充足
C、关于申请人的经历等资料，不具有匹配性或合理性
所谓材料造假，主要指私自刻假章、做假证明、在未经第三方允许的情况下，私自以第三方的名义为自己开据证明。针对这种造假的问题，一旦被查出，将上升到个人信用问题，严重者有可能被终生限制入境。
3、从申请人的学历来看，不具有充分的学习意志和能力
A、学习履历和就学理由不匹配
B、学习意志和能力的证明不充分
C、日语学习经历没有可信度
D、日语能力证明不充分
4、提交的资料不具有可信度
开出的材料要规范化，印章清晰，语句通顺，不要有污迹等等。
三、日本留学签证办理所需材料
(1)签证申请书(贴付照片：2寸白色背景)，日本非常注重申请文件的真实性，丝毫造假都有可能导致申请不成功，因此请尽量如实填写。这一点是必须要注意的。
签证申请表中4.5*112.5px的照片格式在日本情况下都视作标准格式，因此可考虑在国内多印几份带到日本。在日本，证件照多为机器拍摄，每套价格在500日元至700日元不等，较之国内昂贵不少。
(2)护照
(3)户口本复印件：首页及申请人页。
(4)暂住证或居住证明(限户籍非本馆管辖范围者)
(5)在留资格认定书的原件和复印件
(6)留学调查表(固定格式，官网下载)
(7)经费支付人的在职证明，一般都是指自己的父母家人，这是日方鉴定你的家庭经济能力的衡量水准之一。
(8)国内就读院校的毕业证书(原件复印件皆可)大专以上学历(2001以后毕业的)须提供中国高等教育学生信息网发行的教育部学历证书电子注册备案表复印件。
