日本的本科学制通常为4年，但是医学，牙医学，兽医学等特殊学科学制通常为6年。
在日本本科阶段的学习以修学分为主，通常需修满124个以上的学分才允许毕业(医学，牙医学学生通常需修满188个学分以上才允许毕业，兽医学学生通常需修满182个学分以上才可毕业)。
同中国大学本科一样，完成规定的学分和课程毕业后会授予学士学位。
大学院，相当与我国的研究生院，设有硕士和博士课程。
硕士在日本被称做“修士”，硕士课程通常为2年，申请入学者只限于受过16年学校教育、已经大学毕业、或被认可具有同等学习能力的人。
学生取得专业科目的必要学分，通常为30以上的学分。
日本的博士课程学制通常为3年，医学，牙医学，兽医学的博士课程学制通常为4年。博士课程申请者只限于具有硕士学位，或被承认具有同等学习能力者。
日本的博士学位代表着最高学历水平，修学难度也是最难，主要分为两种：课程博士和论文博士。
课程博士生应取得30以上的学分(包括在硕士课程中取得的学分)，考试合格并通过论文审查即可获得博士学位。
论文博士，按照学校的规定，通过博士论文审查，具有课程博士同等以上学习能力者，也可获得博士学位。
根据学校的不同，也有开设硕博连读5年博士一贯制课程。此类博士课程分为博士前期及博士后期两部分，前期学制为2年，后期为3年，实际上，博士前期就是硕士阶段，后期即为博士阶段。
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