西北航空公司是私有企业，由任命的董事会管理。该委员会由70名成员组成，截至2011年，由William A. Osborn '69 担任主席，将其权力下放给当选总统，以担任该大学的首席执行官。西北航空公司在其历史上有十六位总统（不包括临时总统），现任总统莫顿·沙皮罗（Morton O. Schapiro）是经济学家，接替了亨利·比嫩（Henry Bienen），他的14年任期于2009年8月31日结束。校长由副校长，董事和其他助理组成，负责行政，财务，教职员工和学生事务。 乔纳森·霍洛威（Jonathan Holloway）自2017年8月起担任教务长，在校长的领导下担任大学的首席学术官，每所学院的院长，跨学科部门的负责人以及常务委员会的主席均向该校负责。
该相关学生政府由本科生和研究生协会代表研究生的当选代表。
西北大学由12所学院和学院组成。每所学校的教职人员均由学校院长和教学人员组成。教师负责教学，研究，为学生提供建议以及在委员会中任职。每所学校的入学要求，学位要求，学习课程以及学科和学位建议均由该学校教职员工（副教授及以上）决定。
2003年，西北航空完成了为期五年的资本募集活动，筹集了15.5亿美元，比目标多了5.5亿美元。2007年，该大学以7亿美元的价格出售了其在止痛药Lyrica中的特许权使用费，该药物是由理查德·布鲁斯·西尔弗曼（Richar Bruce Silverman）（约翰·埃文斯化学教授）在西北制药公司开发的。这是有史以来最大的此类出售，其收益被添加到捐赠中。
2014年，西北航空宣布了“ We Will Campaign”，其筹款目标为37.5亿美元。截至2017年2月28日，该大学已实现其目标的33.1亿美元。
