黄连素是一种重要的生物碱，是我国应用已久的中药。可从黄连、黄柏、三颗针等植物中提取。黄连素能对抗病原微生物，对多种细菌如痢疾杆菌、结核杆菌、肺炎球菌、伤寒杆菌及白喉杆菌等都有抑制作用，其中对痢疾杆菌作用最强，常用来治疗细菌性胃肠炎、痢疾等消化道疾病。
由 悉尼大学 “莱昂纳德·乌尔曼代谢系统生物学讲席教授”大卫·詹姆斯、 悉尼大学 在读博士生艾丽斯·尼达姆等发表在《细胞报告》上的论文 《Phosphoproteomics of Acute Cell Stressors Targeting Exercise Signaling Networks Reveal Drug Interactions Regulating Protein Secretion》（https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(19)31294-X#secsectitle0030）中提到研究人员首次测量了黄连素对细胞的影响。
该论文的第一作者艾丽斯·尼达姆分享了有关对黄连素研究的起因和经过。
问：为什么会在研究中加入对黄连素的分析？
艾丽斯：我们的研究测量了一组导致细胞急性应激的治疗方法的整体效果。我们的目的是研究细胞对刺激的反应，这些反应与运动产生的反应有关。
选择黄连素是因为有报道称黄连素能激活腺苷酸活化蛋白（AMPK） 激酶 ，这与我们的研究有关，因为AMPK激酶在运动中被激活。重要的是，该实验还让我们了解了有关治疗作用的更多信息。尽管我们不知道黄连素调节细胞信号传导的程度，但由于人服用黄连素， 这 使得我们对黄连素特别感兴趣 。
问：论文中测量黄连素对细胞的影响尚属全球首次，这是如何做到的？
艾丽斯：我们使用了基于质谱的磷酸化蛋白质组学，以无偏方式测量了蛋白质上的数千个磷酸化位点。这样可以读出细胞的功能，非常接近表型结果。黄连素调节培养的肌肉样细胞中385种磷酸肽的丰度。 这给出了由黄连素激活的信号传导的全局图，这是我们所知第一次被测量。
我们测量了作为AMPK激活剂的六种不同治疗方法的效果，让我们比较了它们的效果。黄连素和DNP对特定的AMPK激活剂A-769662和AICAR调节了一组额外的磷酸位。由于这些磷酸位点不是AMPK的靶标，因此表明黄连素可激活AMPK的其他激酶。这是有道理的，因为黄连素和DNP被认为是通过线粒体应激激活AMPK的，所以其他途径也可以被这种刺激激活。补充数据中提供了所有受管制的磷酸酯类，以供参阅。
