CS和CE这两个项目非常相似，两个项目都学习编程和软件开发的基础学科，两者之间最基本的区别可以归结为理科（science）和工科（engineering）的区别。science的意思是知识或学问，它是来自拉丁单词“to know”，engineering则是来自拉丁单词“to contrive”。因此从操作层面来看两者的区别是CE的学生拥有对电路、电子学和VLSI设计的非常深厚的认知，而这些都是现代计算机实际结构中至关重要的；CS的学生学习的是代数、计算和编程语言，这些构成了高级程序设计和计算的基础。但是这样的描述事实还是不够准确，因为比如SE（Software Engineering ）分支有时候会放在CE下，有时候又会放在CS下，这也要具体情况具体分析，具体学校具体对待。
我们可以这样来理解：广义的CE就是应用性的computer 相关的，CS会更理论一些。这也就是为什么SE（软件工程）是软件相关，可是却会放在CE（计算机工程）下的原因，SE是用工程的思维去开发一个软件项目的方式方法的学习。另外一方面，有一些狭义的划分，SE又会放在CS下，这样的划分就是按照软硬的划分了，CS是软，CE是硬。但是核心都是computer。因为每个学校都有自己的划分方式，所以没有统一的标准。同时，软硬现在已经你中有我，我中有你了。比如说，CPU里是有指令集的，离开了指令集，CPU也没有办法工作。而先进的软件都会针对硬件进行优化，没有足够的优化，就会出现多年前经常会出现的兼容问题了。这是两者之间的区别。
CS在计算机系统和软件的理论和设计，以及重要的应用领域培养学生。CS主要的研究领域和学习领域包括14个主要方向：
系统与网络(System an Network)
人工智能与机器人(Artificia Inteigence an Robotics)
计算机隐私与安全(Privacy an Security)
编程语言(Programming anguage)
数据库(Database)
计算机图形学(Computer Graphics)
生物信息学与计算生物学(Bioinformatics an Computationa Bioogy)，
算法(Agorithm)
计算机理论(Computer Theory)
科学计算(Scientific Computing)
软件工程(Software Engineering)
计算机视觉(Computer Vision)
计算机体系结构(Computer Architecture)
人机交互(Human Computer Interaction)
