20世纪末，女性在哈佛的地位也开始不断上升。初期，女性学生仍集中在拉德克利夫学院。虽然越来越多的女学生愿意报读哈佛的课程，但哈佛的学生仍以男性居多，五个学生里平均只有一个女性1999年，拉德克利夫学院正式成为哈佛大学的拉德克利夫高等研究学院。
时任院长的德鲁·吉尔平·福斯特也后在2007年正式成为哈佛创校300多年以来第一位女性校长，亦是继宾夕法尼亚大学、布朗大学与普林斯顿大学后，常春藤盟校的第四位女性校长。
截至2014年，哈佛大学下设13个学院，分别为哈佛大学文理学院、哈佛商学院、哈佛大学设计学院、牙科医学、哈佛大学神学院、教育学院、哈佛法学院、哈佛医学院、哈佛大学公共卫生学院、哈佛大学肯尼迪政治学院、工程与应用科学院、哈佛大学研究生院、哈佛学院，另设有拉德克利夫高等研究学院，总共在46个本科专业 、134个研究生专业招生；其中本科生教育主体由哈佛学院承担。哈佛法学院（Harvar Law School）创立于1817年，虽然比大学部（Harvar College）建校（1636）晚几近两百年，仍是美国最古老的法学院。哈佛商学院（Harvar Business School）是如今美国乃至全世界最大、最富、最有名望，也最具权威的管理学校。这里是商业人才培育的圣地，被称作商人、主管、总经理的西点军校，美国大企业家和政治家都曾在此学习；在美国500家最大公司里担任最高职位的经理中，有1/5毕业于这所学院。哈佛工商管理硕士学位（Master of Business Aministration）是权力与金钱的象征，也是美国青年梦寐以求的学位。
