马来西亚高等教育体系包括公立和私立两部分。公立高校包括公立大学、公立学院和技术职业学院，私立高校包括私立大学、私立大学学院、私立学院和外国大学分校。公立大学、私立大学、私立大学学院和部分公立学院具有颁发本校大专及大专以上文凭的资格。专科学制2-3年，本科学制3年，硕士学制1-2年、博士学制2-6年。
马来西亚教育部是高等教育主管部门，对高校的设立行使行政审批权。马高校所开设课程需经教育部以及国家学术鉴定局（MQA）双重核准。国家学术鉴定局还负责对课程质量的监督审查。
公立大学
1. 马来西亚国际伊斯兰大学（马来文：Universiti Islam Antarabangsa Malaysia）
2. 马来西亚国民大学（马来文：Universiti Kebangsaan Malaysia）
3. 马来亚大学（马来文：Universiti Malaya）
4. 马来西亚吉兰丹大学（马来文：Universiti Malaysia Kelantan）
5. 马来西亚彭亨大学（马来文：Universiti Malaysia Pahang）
6. 马来西亚玻璃市大学（马来文：Universiti Malaysia Perlis）
7. 马来西亚沙巴大学（马来文：Universiti Malaysia Sabah）
8. 马来西亚砂拉越大学（马来文：Universiti Malaysia Sarawak
9. 马来西亚登嘉楼大学（马来文：Universiti Malaysia Terengganu）
10. 苏丹依德理斯教育大学（马来文：Universiti Peniikan Sultan Iris）
私立大学
1. 科学及科技大学（英文：AIMST University）
2. AL-Mainah国际大学（英文：AL-Mainah International University）
3. 亚洲城市大学（英文： Asia Metropolitan University）
4. 亚太科技大学（英文： Asia Pacific University of Technology an Innovation）
5. 百纳利管理与创业大学（英文： Binary University of Management an Entrepreneurship）
6. 城市大学（英文： City University）
7. DRB-HICOM University of Automotive Malaysia
8. GlobalNxt University
9. 精英大学（英文： HELP University）
10. 吉隆坡建设大学（英文： Infrastructure University Kuala Lumpur）
11. 国际伊斯兰金融教育中心（英文： International Centre for Eucation in Islamic Finance）
大学学院
1. 成功礼待大学学院（英文： BERJAYA University College of Hospitality）
2. 赛柏再也医药理科大学学院（英文： Cyberjaya University College of Meical Sciences）
3. 英沙尼亚大学学院（英文： INSANIAH University College）
4. 雪兰莪国际伊斯兰大学学院（英文： International Islamic University College Selangor）
5. 双德国际科技大学学院（英文： International University College of Technology Twintech）
6. KPJ国际大学学院（英文： KPJ Healthcare University College）
7. 吉隆坡首都大学学院（英文： Kuala Lumpur Metropolitan University College
8. 林登大学学院（英文： Linton University College）
9. 林肯大学学院（英文： Lincoln University College）
10. TATI大学学院（英文： TATI University College）
11. 北斯达利大学学院（英文： University College Bestari）
12. 马六甲伊斯兰大学学院（英文： University College of Islam Malacca）
私立院校
1. 国际艺术学院（马来文：Akaemi Seni Buaya an Warisan Kebangsaan）
2. 师范学院（马来文：Institut Peniikan Guru）
3. Putra Business School
外国大学分校
1. 科廷大学马来西亚沙捞越分校（英文：Curtin University of Technology Sarawak Campus Malaysia）
2. 莫纳什大学马来西亚分校（英文：Monash University Malaysia Campus）
3. 诺丁汉大学马来西亚分校（英文：The the University of Nottingham in Malaysia）
