澳门目前有两所大学开设药剂相关的硕士学位课程，分别是澳门大学和澳门科技大学。
澳门大学将于2026/2027学年新增哲学硕士学位（药物科学）课程，由中华医药研究院开设。该课程旨在培养具备创新药物研发、精准医疗和疾病防治专业能力的高层次药学人才。课程内容涵盖高等药理学与毒理学、药物化学与植物化学、现代药剂学、计算药学、结构生物学、药物研发等核心领域，深度融合现代药学与中医药研究精髓，并结合人工智能等新兴技术在制药领域的创新应用。毕业生职业发展前景广阔，可在制药企业研发部门、科研机构、政府监管部门、医疗机构药学部门、跨国药企等多元领域发展。该课程为2026/2027学年新增课程，报名截止日期为2026年3月13日。
澳门科技大学医学院药学院开设药学硕士学位课程，正常修读期限为30个月，修业期限为48个月，授课语言为英文。报读要求方面，申请者须具有学士学位，本科修读中、西药学及相关专业，并通过澳门科技大学的入学考核。英语能力证明方面，接受大学英语四级450分或以上、大学英语六级430分或以上、托福80分或以上、雅思6.0或以上等成绩。申请时需提交约1000字的研究计划，并提前联络意向指导教授。课程设置方面，完成课程需修读共计42学分，包括5门必修科目、4门选修科目以及论文。必修科目涵盖药学英语、药学前沿进展、临床药理学、高等药学实验方法学、科技文献检索与论文写作；选修科目包括医学统计学、现代生物技术与新药研究、高等药剂学、高等药物化学、仪器分析、临床循证药学等。毕业要求方面，学生需完成所有课程学习，通常需在SCI英文期刊以一作者发表至少一篇研究论文，并以英文撰写毕业论文及进行英文答辩。学费方面，2026学年学费约为120,000港币/年。此外，该校课程得到中药质量研究国家重点实验室的支持，师资力量雄厚，拥有一批院士、国家杰青、长江学者等著名学者。
需要特别提示的是关于执业资格的问题。澳门药剂师注册申请须符合澳门特别行政区政府药物监督管理局的要求，完成上述药学硕士学位课程并不代表自动具备申请澳门药剂师执业资格。如有意在香港或内地执业，还需了解当地相应的注册要求。
综合来看，澳门大学和澳门科技大学各具特色。澳门大学侧重药物科学综合方向，为2026年新增课程，需注意申请截止时间；澳门科技大学课程设置完善，研究导向明确，但毕业要求较高，需发表SCI论文。
