普林斯顿神经科学博士课程的课程作业基于这样一种理念，即实践经验是获得真正理解的重要组成部分。在第一年，所有学生都会参加为期一年的独特核心课程，该课程调查当前的神经科学。讲座涵盖的主题伴随着实验室的直接经验。学生通过第一手经验学习如何运行自己的功能磁共振成像实验;设计和运行自己的神经网络计算机模拟;对实时神经活动进行成像;以及膜片钳单细胞，仅举几个例子。本课程为学生提供了一个独特的机会来学习成功开发新实验和技术所必需的实践知识。不需要以前的实验经验。
完成博士课程平均需要五年时间：两年的课程和大约三年的论文研究和论文写作。
第一年：
1.在博士学位的第一年，学生参加神经科学核心课程。这个为期两学期的核心课程的目标是提供一个共同的基础，以便所有新生都有共同的能力水平。本核心课程旨在通过实践实验室经验、讲座和计算建模相结合的方式概述所有主题。
2.除了神经科学核心课程外，学生还将在第一年学习神经科学数学工具。本讲座课程将向学生介绍分析、建模和作生物数据集所需的数学、统计和计算工具。
第二年：学生必须在两个学期的半日制教学，通常是在第二年。在二年级，学生参加该系的 NSF 资助写作研讨会，为在 10 月向 NSF-GRFP 提交提案做准备。
资格考试：通常在学生满足所有正式课程和教学要求后，在学习第三年的 10 月普通考试期间进行。学生将展示他们的论文计划，展示他们所选择的研究主题和围绕它的现有文献的掌握，并提出一个合乎逻辑的计划来解决他们确定的关键问题。文学硕士 （MA） 学位是获得正式博士学位候选资格的附带学位，在学生成功通过普通考试后获得。它也可以授予因各种原因离开博士课程的学生，前提是满足以下要求：完成正式课程和至少两次实验室轮换博士生。研究经验必须包括至少一年的实验室独立工作，并且必须通过至少一部分将军考试来证明能力。教师导师和将军考试委员会必须批准将军考试的评估。根据考试委员会的推荐，学生可以获得硕士学位。
第三-第五年：进入研究阶段
每个研究生选择一个论文委员会，该委员会由论文导师和另外两名教职员工组成。至少两名委员会成员必须是 PNI 的核心教师。论文委员会每年至少召开一次会议。该委员会的目的是在学生的研究过程中为学生提供建议。研究生应每年至少与他们的委员会会面一次。
博士学位是在候选人的博士论文被接受并持续进行最终公开口试后授予的。
