詹姆斯库克大学有许多优势专业，以下是一些较为突出的：
- 热带生物科学：作为澳洲第一座热带大学，JCU 在热带相关领域国际声誉高，热带生物科学专业全球领先。其凯恩斯校区是世界顶尖的热带雨林研究中心，澳大利亚热带雨林协会为该校区提供大量生物技术科研机会。
- 海洋科学：这是 JCU 规模最大的强项研究领域，学校25% 以上的预算用于该领域研究，其海洋学科是全球顶尖之一，在地球与海洋科学方面，在 2023 年 QS 世界大学学科排名中位列全球51 -100。
- 酒店管理：在澳洲大学专业学术排名前十，是该校强项专业之一。在 2023 年 QS 世界大学学科排名中，酒店与休闲管理专业全球排名51 - 100，该专业研究成果在领域内影响力大。
- 工商管理：JCU 的 MBA 课程在澳大利亚声誉高，排名前五。课程更贴近亚洲，符合学生需求，受到很多学生青睐。
- 环境科学：在2023年 QS 世界大学学科排名中全球排名101 - 150，该专业运用应用科学与工程方法改善环境，为人类和其他生物体提供健康的生存环境，对申请人专业背景无特别限制。
- 会计学：受到澳洲专业会计机构认可，课程广泛，注重培养学生处理问题的能力，是澳洲热门专业之一。
- 护理专业：以 QS 澳大利亚生命科学与医学排名为例，詹姆斯库克大学护理专业排名澳大利亚第12 名，并设有多项课程项目供学生选择。
