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东京大学（医学部）在日本的医科大学中的门栏高度之最，淘汰率之高，令人乍舌。但是正因如此，保证了东大在亚洲大学第一的地位和超高的教育质量。
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庆应义塾大学（医学部）作为私立大学中的第一名校，庆应义塾大学的师资以及教学力量毋庸置疑。但是私立大学医学学费过于昂贵且学制年限长，并不太适合工薪家庭的留学生。
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京都大学（医学部）京都大学与东京大学的关系有点类似中国的北大和清华。作为日本数一数二的国立之最，京都大学医学部的师资和技术绝不会落后于东大。
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大阪大学（医学部）2020年的泰晤士世界大学排名中，大阪大学排名301-350，近几年的排名都比较稳定。且大阪大学的汤川秀树是日本第一位诺贝尔奖得主，不仅如此还诞生了沃尔夫奖、拉斯克奖等的得主。
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东京医科齿科大学（医学部）东京医科齿科大学，简称东京医齿大，是日本著名的国立大学。现在，东京医科齿科大学拥有2个学部、2个研究科、2所图书馆、2所附属医院，以及众多的研究机构。作为日本最好的牙科大学，其综合实力可与东大、京大一较高下。学牙科，就到东京医科牙科大学。
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九州大学（医学部）九州大学，医学部发展历史是很悠久的，而且九大的癌症治疗，齿科和心脏介入在日本和世界都是很有名的，也有很多的人才，比如说日本第一个诺贝尔生物学奖的得主，利根川进现在就是九大的抗体研究中心的导师。
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东北大学（医学部）东北大学，医学部在国立大学的医学部中，实力也是前列，本着“研究第一”为目的，设立的高端研究教学设施，聘请高级顶端医学教员，是各国留学生求医学医的首选(此校的外国留学生，有50%的中国留学生)。
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东京慈恵会医科大学（医学部）2020年泰晤士世界大学排名中，位居庆应义塾大学之上。并且，东京慈恵会医科大学医学部是日本私立大学历史最悠久的名门医学部御三家的其中一家，入学难度可想而知。
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顺天堂大学（医学部）顺天堂大学，简称为“顺大”。东京大学医学部就是由顺天堂大学初代堂主所创办。私立大学医学部中，授课费最便宜，医生国家考试通过率高而出名。自然实力也不会弱。
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日本医科大学（医学部）日本医科大学，与庆应，东京慈惠医学部并称医科大学御三家，历史悠久，文化底蕴深厚。高质量的医学教育水平，在医科大学中也是极为有名。6年间学费约2800万日元。
