鹿儿岛大学在1949年学制改革时，由旧制学校中的第七高等学校造士馆（1901年设立立）、公立鹿儿岛农林专门学校（1908年设立）、鹿儿岛青年师范学校（1944年设立）以及鹿儿岛水产专门学校（1946年设立）统合而成。
目前鹿儿岛大学拥有9个学部和11个大学院研究科。
本科学部分别是法文学部、教育学部、理学部、医学部、齿学部、工学部、农学部、共同兽医学部、水产学部。
大学院研究科分别是人文社会科学研究科、教育学研究科、保健学研究科、农学研究科、水产学研究科、理工学研究科、医齿学综合研究科、联合农学研究科、司法政策研究科、临床心理学研究科、联合兽医学研究科。
该校大约有9000名本科生，2000名研究生（包括300名留学生）及大约2500名教职工（2013年5月数据）。
鹿儿岛大学不仅致力于地方发展，还重视对外的交流合作，与多国大学建立了合作关系，比如中国的中南大学、湖南大学、中国人民大学、中国社会科学院日本研究所，韩国的几周大学校等。
