一、日本留学修士和研究生的定义不同
日本的修士是硕士，日本修士毕业一般有相应的学分要求，原则上需要达到30学分。
日本研究生等同于国内我们所认为的硕士研究生预科。日本研究生并没有学位，也可以不修学分。
二、日本留学修士和研究生的学制不同
日本留学修士一般读2年左右
日本研究生最少读半年，最多读2年。
三、日本留学修士和研究生学费不同
1、日本留学修士学费
日本国立大学修士学费一年约75万日元。
日本公立大学修士学费一年约82万日元。
日本私立大学修士学费：人文科约100万日元，折合成人民币约6万；社会科学约103万日元，折合成人民币约6.3万；医学约109万日元，折合成人民币约6.3万；农学约115万日元，折合成人民币约7万。
2、日本留学研究生学费一年346800日元（约人民币1.8万元）
四、日本留学修士和研究生入学时间不同
日本留学修士入学时间一般是在4月份、部分学校会有10月入学，具体入学时间还是以学校公布的要项为准。多数日本修士考试会在每年6～8月开始发放招生简章，考试时间最早从8月开始举行，时间最长延续到隔年3月，这是因为部分学校实施二次招生的缘故。第一次招生时间原则上在8月～10月间，称为“秋季考试”，第二次招生时间原则上自入学当年的1月～3月，称为“春季考试”。
日本研究生一年有2次入学时间分别为4月和10月，也有个别学校只有4月入学。一般需要提前半年到一年开始申请。
五、日本留学修士和研究生申请制度不同
（一）日本留学修士制度
日本留学修士分为直申制和考试制，其中考试制居多，日本留学修士考试类似于我国的研究生入学考试，但也有所不同的是，日本大学院入学考试是由学校单独出题，考试内容并不统一，而且考试时间也有2次。
修士考试一般会从笔试、面试、小论文、书类选考中的1-3种。学校和专业不同，笔试的内容和形式也会有差别。
笔试
笔试一般包括一到两门专业课，文科会考所在讲座和专攻的专业科目，理工科很可能会考数学，还会让你在几门科目中自选一科之类。艺术类的学生，一般还要提交自己的作品集。笔试的第二大项是语言，大部分要求考外语，有的规定英语，有的让考生在几门语言里选择，也有一部分文学研究科要求考日语。
面试
面试会由整个讲座的教授来共同进行，一般会面对五位以上的教授，当然，也有的教授不会开口提问；整个面试过程中，会以你所在研究室的教授为主来进行提问。所有的问题都是围绕着研究计划书进行的；此外，教授也可能会针对你笔试的答卷问一些感兴趣的问题。
1、日本留学研究生申请内诺制
日本大多数大学的研究科采取内诺制的方式招收留学生研究生。学生需要提前半年到一年与意向大学的意向教授取得联系，并获得教授的认可，取得内诺，才有去日本读研究生的资格。留学老师提醒在内诺制的研究科里，教授对于招收学生有绝对的话语权。按专业来划分的话，理工科的内诺制研究科会相对较多。这个也是所有申请制度最常见的一种做法。
2、日本留学研究生申请事前审查
事前审查是指教授没有录取权，如果想申请，就要在“募集要项”规定的时间内向学校提交规定的文件，由院系教授组成的审议会进行考核，审议会同意了才可以，而且有时会根据你的情况给你安排其他教授作为导师而不是你志愿的教授。事前审查制度一般在文科和商科的专业中比较普遍，随着近两年学校制度的改革，好多学校从内诺制转为直申或者事前审查。
3、日本留学研究生申请直申制
直申即不需通过与教授的联系，直接向日本学校或者研究科提交研究生的申请。这种申请制度下，单个教授对招收学生的话语权相对有限，通常需要教授开会来审议学生是否有资格作为研究生进行学习。以专业来说，商科、法学遇到直申的情况会高于其他专业。
