澳门科技大学共有9大学院，学制为两年制，中英混授课，每个学院课程如下：
酒店与旅游管理学院：
（1）国际旅游管理硕士，专业研究领域包括会展与节庆管理，旅游规划与管理，酒店管理
（2）酒店管理硕士，本科申请要求酒店管理、商学、管理学或相关专业; 或具旅游管理、酒店管理及相关行业至少1年以上工作经验 。
商学院：
（1）工商管理硕士，本科申请所需专业不限，需要两年全职工作经验。
（2）公共行政管理硕士，本科申请所需专业不限。
（3）高级管理人员工商管理硕士，本科申请所需专业不限，须具5年或以上管理类工作经验。
（4）管理硕士，本科申请所需专业不限。
（5）金融硕士，本科申请所需专业不限。
（6）会计硕士，本科申请所需会计，财务管理或者相关。
（7）公益与社会组织管理硕士，本科申请所需专业不限。
（8）商业分析学硕士，本科申请所需专业不限。
（9）应用经济学硕士，本科申请所需专业不限。
（10）供应链管理学硕士，本科申请所需专业不限。
人文艺术学院：
（1）传播学硕士，本科申请所需专业不限。
（2）设计学硕士，修读艺术设计相关专业(色盲、色弱者不可报读)
（3）电影管理硕士，本科申请所需专业不限。
（4）电影製作硕士，本科申请所需专业不限。
（5）美术学硕士，修读艺术学或相关专业 (色盲、色弱者不可报读)，美术史研究
修读艺术学或人文社会相关专业。
（6）建筑学硕士，要求修读建筑学专业（如：建筑学学士BArch，或建筑学工学学士、建筑学文学士、建筑学理学士），或建筑学相关学科之城乡规划、城市设计、风景园林学士（色盲、色弱者不可报读）
（7）互动媒体艺术硕士，专业不限，修读资讯科技、艺术设计学或相关专业者优先考虑 (色盲、色弱者不可报读)
（8）创新音乐硕士，申请人须具音乐学学士学位或更高学歷资格; 或具音乐相关学科学士学位或更高学歷资格并提供音乐考级证书; 申请人须提交一份履歷简介及专业研究计划及一段音乐成果视频。
法学院：
（1）法学硕士，要求本科期间修读法学专业
（2）法律硕士，专业不限，但法学专业除外
（3）国际经济与商法硕士，修读法学、管理或相关专业
（4）刑事司法硕士，要求本科专业不限
（5）国际仲裁硕士，要求本科专业不限
（6）金融犯罪与监管硕士，具有法学、经济学及管理学专业的本科毕业生；具有其他专业本科毕业生并具有法律、金融从业经验或资格之人士。
