Bioinformatics生物信息学分支方向&研究方向
1.基因组学和转录组学(Genomics, transcriptomics and metabolomics)主要是研究基因组和转录组的组成，结构和功能，并对他们分析生物学过程的影响。
基因组学:主要研究是基因组DNA使用方法目前以二代测序为主，将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法进行迭代组装。
转录组学:转录组学研究的是某个时间点的 mRNA总和，可以用芯片，也可以用测序。
2.蛋白质组学(proteomics):蛋白组学针对的是全体蛋白，组要以2D-Gel和质谱为主，分为top-down和bottom-up分析方法。理念和基因组类似，将蛋白用特定的物料化学手段分解成小肽段，在通过质量反推蛋白序列，最后进行搜索，标识已知未知的蛋白序列。
3.代谢组学(Metabonomics/
Metabolomics)研究生物体代谢产物的组成和代谢的途径，并分析他们对生物学过程的影响。
生物体系代谢分析4大层次:1.代谢物靶标分析2.代谢物指纹分析3.代谢轮廓分析4.代谢组分析
4.系统生物学(Systems biology):研究生物系统中所有成分，基因MRNA蛋白质的构成，研究所有基因，所有蛋白质组分之间的所有关系。
5.生物信息学工具开发(Bioinformatics tool development):研究和开发用于生物信息学研究的计算工具和软件。
6.生物信息学应用(Bioinformatics
applications):将生物信息学应用于医学、农业、生物技术和环境保护等领域，研究和解决相关问题。
7.人类基因组计划和其他基因组计划的研究(Genetic Organization Project):研究人类和其他生物的基因组，包括基因组的组成、结构、功能以及与疾病等方面的关联。 Eg: Human Pangenome Reference Consortium, HPRC
8.生物信息学的数据管理和分析
(Bioinformatics-Data management and analytics):研究生物信息学数据的存储、管理、处理和分析方法，以及如何有效地获取、整合和解释生物学数据。
9.比较基因组学(Comparative genomics):比较不同物种的基因组结构、功能和进化关系，以了解生物多样性的起源和演化。
10.系统医学(Bioinformatics is used in systems Medicine):将生物信息学应用于医学领域，研究人体健康和疾病的分子机制，以及个体化医疗和药物设计。
Bioinformatics学生背景以及技能要求:
Bioinformatics PHD学生需要加强python和Data Science能力，更够写一些复杂的 Standalone tool，掌握数据分析算法能力。数据挖掘算法分类:
Eg:1.连接分析:PageRank。
2.相关分析: Apriori。
3.分类算法:C4.5，简单的贝叶斯SVM， KNN， Adaboost， CART。
4.聚类算法:K-Means，EM
Bioinformatics生物信息定义
信息技术+生物技术(IT+BT，干湿结合)会是未来的研发主流，目前生信在生物学(包括应用层面的医药等)中的地位还是技术支持型岗位。一般都是帮忙分析数据的，真正的研究leader还是那些深入掌握了生物研发技术、了解具体领域的生命活动机制的。
Bioinformatics PHD直博申请要求:
Bioinformatics 直博适合本科背景优秀(有较好的科研资源)eg:海本/国内TOP 985大二明确自己的热爱小方向，直博难度较大，当然科研能力以及科研潜力也是美国教授想从本科直博学生身上想看到的。所以可以从大二开始充分利用自己的资源和自己导师的资源，进行科研项目，去实验室学习，陆本学生有条件的也可以去美国进行交换项目，海外科研项目，有助于拿到美国教授的推荐信，直博绩点最低要求 3.5+/4，最好有一篇第一作者的文章，当然还是比较有难度的，再说一遍可能一开始是去实验室打杂，很正常都是从一些小事做起的，关于直博GRE 重要吗?门槛作用，基本上320+，不必花费过多时间，最后如果你的本科背景优秀，并且十分热爱自己的小方向.有优秀的的科研经历，请大胆尝试直博申请。
博士申请看导师实验室情况，不能只看排名
最近咨询的很多学生直接问我可以申请什么排名的博士院校?在这里说下博士申请和硕士申请的逻辑是完全不同的，硕士是根据绩点实习科研情况去可以基本定位排名的，博士申请是要综合去考虑的，和你小方向匹配的导师实验室以及奖学金Funding情况，很多好的导师不一定会在排名靠前的博士院校。因为有的院校相对来说福利和资源比较好，排名可以作为参考，但绝对不是博士申请中只看的部分!
生物信息学就业前景:
生物信息学专业毕业生可以在生物医药研究机构从事基因组学、转录组学、蛋白质组学等方面的研究工作。生物信息技术公司:生物信息技术公司需要生物信息学专业人才从事生物信息数据分析、软件开发等工作。医疗保健行业:生物信息学专业毕业生可以在医疗保健行业从事基因检测、个性化医疗等方面的工作。学术界:生物信息学专业毕业生可以在高校从事教学和科研工作。总之，随着生物技术和计算机技术的不断发展，生物信息学专业的就业前景非常广阔，未来还将有更多的就业机会出现。
