伯尔尼大学创建历史可以追溯到十六世纪早期建立的神学院，当时建校的目的是为宗教改革培养清教徒牧师。学校在建校时拥有3位教授，到十七世纪末拥有6位教授。到十八世纪学校在人文和神学领域一直处于统治地位。 伯尔尼大学位于瑞士中西部伯尔尼州的首府、瑞士首都伯尔尼市，地处德语区。伯尔尼是瑞士第四大城市，自从1848年在这里设立了联邦政府以来，一直是瑞士的政治和文化中心。阿勒河把伯尔尼分为西岸的老城和东岸的新城。伯尔尼素有熊城、泉城和手表王国的美称。作为瑞士农产品的集散地和铁路交通的枢纽，这里有铁路与苏黎士和日内瓦相通。伯尔尼位于法语区与德语区的交界处，语言以德语为主，但也讲法语。
伯尔尼大学下辖神学院，法学院，经济与社会科学学院，医学院，Vetsuisse动物学院，人文学院，人类科学学院，科学学院等八个学院。
伯尔尼大学提供本科、硕士和博士层次的高等教育，该校开设的专业丰富多彩，比如神学，工商管理学，法律，政治科学，社会学，医学，艺术史，戏剧，考古学，东方文化研究，哲学，牙科学，宗教研究，地理学，物理学，生物学，化学与分子科学，统计学，体育等等。
