东京大学诞生于1877年，由“东京开成学校”与“东京医学校”在明治维新期间合并改制而成，初设法学、理学、文学、医学四个学部和一所大学预备学校，部分科系最早可以溯源到灵元天皇时期；学校于1886年更名为“帝国大学”，也是日本建立的第1所帝国大学；1897年，易名为“东京帝国大学”；二战后的1947年9月，正式定名为“东京大学”。
东京大学是采取学院制的大学，各校区实际可以称为骑场学院、本乡学院和柏学院。每个学院的自主权大，授课时问都不一样。但另一方面，学生在选择选修课的时候，有着较大的自由权力，所有学院的课程都可以选修。
