授课型硕士
授课型硕士与本科阶段的学习模式相似：选课（包括必修和选修课）、上课、完成作业、参加期中和期末考试，完成学位论文。学生需要按照课程表上课，课堂上也会有考勤（考勤会记录到个人成绩中）。同时，授课型硕士还需要通过参与讲座及其他的学术活动来获得学分，最终提交小论文或通过毕业考试获得硕士学位。 通常小型学术演讲（presentation）或者小论文很常见。许多课程要求学生写论文，理工科学生需要提交实验报告或项目报告、研究报告等，最后进行演讲展示。 大马的公立院校除北方大学是一年三个学期（每年1月、5月和10月开学）外，其他学校都是一年两个学期（3月和9月入学）。大多数授课型硕士学位的毕业要求是：通过所有课程并取得至少CGPA3.0 的成绩。
研究型硕士
研究型硕士主要是通过某个项目或课题的研究完成学习。通常在第一学期需要修习研究方法论和学术写作的课程，上课时间取决于学校的安排。同时和导师保持定期的沟通和联系，进行论文开题的写作，并在导师的专业指导下完成论文。 一般学院会要求学生每学期提交一次论文的进度报告（Progress Report），而导师也会定期要求提交。马来西亚的公立学校会要求学生在学习期间完成马来语课程的修读，并至少达到C的成绩。此外，研究型硕士还需要在毕业前完成论文发表要求。最后，需要进行论文答辩，通过后获得硕士学位。
常见研究型硕士学位有文学硕士（Master of Arts）, 哲学硕士（Master of Philosophy）和理学硕士（Master of Science）三种学位（哲学硕士（MPhil）&理学硕士（MSc））。申请研究型硕博需要提交一篇不少于1000字的研究计划书，计划书内容包括研究背景、研究目的、研究意义、研究问题、研究目标、文献综述和研究方法论等，同时选择和研究方向一致的导师作为意向导师。
混合型硕士
混合型硕士结合了授课型和研究型两种硕士的特点，实际上是一半课程（上课+考试）和一半研究模式的硕士。混合型硕士的论文要求没有研究型那么高，但比授课型硕士论文要求稍微高一点，一般是基于项目的论文。混合型硕士的课程会比研究型多两三门，一般完成4门左右的课程就可以开始准备进行论文写作。 通常，授课型硕士比研究型硕士更容易申请，而混合型硕士限制较多，可供选择的专业也较少。目前，马来西亚国民大学信息科学与技术学院及医学院的混合型硕士目前需要提供研究计划书才能提交申请，其他几所公立大学则不需要。 就毕业难度来讲，授课型硕士需要达到学校要求的学分，完成毕业论文的写作和答辩，基本通过后才能毕业。研究型硕士课程就只有研究方法论和学术写作的课程，其他时间都是和导师一起做研究写论文，学术要求高，毕业难度也会相对增加。
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