以前，日本动画大多是专门学校开设，现在日本的大学也开设动漫课程，为学生提供了更多选择。本科阶段，比如京都精华大学，分为动画、漫画、角色设定等多个专业方向;研究生阶段，比如东京艺术大学的动漫研究生课程，更偏向动画和动画电影制作方向制作的一个硕士课程。建议本科毕业生，可以根据自己的实际需求，选择就读大学院或者专门学校;而高中毕业打算赴日的，我们建议先修读一个本科学位之后，如果有兴趣再选择深造或者工作。毕竟，如果你选择日本留学之后回国工作，本科学位对你还是很重要的。
1.东京艺术大学
东京艺术大学（简称东京艺大、艺大）位于东京都台东区上野公园内的日本艺术类国立大学，主要目的为培养美术和音乐领域的艺术家。
学校由美术学部（绘画科、雕刻科、工艺科、设计科、建筑科、先端艺术表现科、艺术学科）和音乐学部（作曲科、指挥科、声乐科、器乐科、邦乐科、乐理科、音乐环境创造科）等2学部14学科组成。
2.武藏野美术大学
武藏野美术大学是一所美术造型艺术教育的综合性大学，作为日本最出色的动画学府，具有极高的教学质量及学术威望。MAU共有包括美术和设计的11个学科配置。美术学科设有日本画、油画、版画、雕刻4个专业；设计学科有视觉传达、工艺工业、空间演出、基础设计、建筑和映像6个专业。
为开拓新的领域，学校还新设了艺术文化和信息设计2个专业，共计12门专业。
3.多摩美术大学
多摩美术大学（简称多摩美）以“自由与意力”作为教育理念，实践美术和设计的创作研究、不断探求美术教育的应有价值和方式。
多摩美的主要校区分布在八王子和上野毛两地，现为日本规模最大的美术大学。同时与东京艺术大学、武藏野美术大学并称为日本顶级美术大学的御三家。
日本具有动漫制作专业的大学及大学院：
学部：武蔵野美術大学 多摩美術大学 京都造形芸術大学 京都精華大学 東京造形大学 神戸芸術工科大学
大学院：東京芸術大学大学院 東京大学大学院 東北芸術工科大学大学院 宝塚造形芸術大学大学院 映画専門大学院大学
