日本在医学领域一直处于世界领先水平，历史上曾有五位日本学者获得过生理学或医学奖。日本也是人均病床数量最多的国家，拥有发达的医疗体系和广阔的医疗市场。同时，日本医学院校都配套建设了附属医院，拥有丰富的临床训练基地资源，在就读期间就能为学生提供较多的实践机会。因此，不少医学生选择前往日本留学深造。
不过值得注意的是，高校的临床医学专业是不面向国际学生招生的，或是提出非常严格的门槛，留学生进入大学院就读的专业以研究型居多。
医学专业的申请，尤其是临床医学，要求学生有相关的专业背景，本科修读医学专业的同学在申请资格上是基本满足要求的。而本科修读生物或生命科学专业的同学由于在本科阶段学习的专业与医学有一定的相关性，也是有机会实现专业跨越的。除此之外，日本的大多数医学院是有“汉方医学”这个专业的，该专业与国内的中医学有着较大的联系，本科学习中医学的同学完全可以考虑申请这个专业。
院校推荐上，首选必然是七所帝国大学。其中，东京大学、京都大学和大阪大学常年位列QS世界大学排名医学学科的前一百位。
金泽大学和千叶大学为代表的旧制六所医科大学以及广岛大学和东京医科齿科大学为首的新制八所医科大学最初均以医学院校为基础开设，实力雄厚。
＊旧制六大医科大学：千叶大学、金泽大学、新泻大学、冈山大学、长崎大学、熊本大学
＊新制八大医科大学：东京医科齿科大学、弘前大学、群马大学、信州大学、鸟取大学、德岛大学、广岛大学、鹿儿岛大学
＊私立院校，庆应义塾大学、顺天堂大学等也都是非常推荐同学们尝试申请的院校。
攻读硕士或博士学位时，研究方向的选择有时甚至会优先于院校的选择。以下列举几个热点研究方向供各位参考：
＊免疫系统癌症治疗的研究
＊微生物和消化道疾病治疗的研究
＊医学影像和骨骼疾病治疗的研究
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